T hücreli akut lenfoblastik lösemi (T-ALL), olgunlaşan timositlerde görülen agresif malin hastalıktır. T-ALL, pediatrik ALL vakalarının %15'ini ve erişkin ALL vakalarının %25'ini temsil etmektedir. miRNA'lar tek iplikli, 19-25 nukleotit uzunluğunda olan ve endojen "hairpin" yapıdaki transkriptlerden köken alan RNA dizileridir. miRNA'lar, hedef mRNA'lara genelde 3' UTR bölgesindeki komplementerlik gösterdiği bölgeye bağlanarak gen anlatımının düzenlenmesinde rol oynamaktadır. T-ALL ve diğer lösemi tiplerinin yanı sıra birçok kanser tipinde, miRNA'ların özgün anlatım profilleri sergiledikleri bilinmektedir.
Tez kapsamında, miRNA ve mRNA array expresyon verilerinin bir arada değerlendirilmesiyle T-ALL patogenezinde önemli olabilecek etkileşimlerin tespiti ve deneysel validasyonu amaçlanmıştır.
Mikroarray verilerinde yapılan gen anlatımı değişimi analizlerinde, miR-29 ailesi üyelerinin anlatımındaki azalmaya karşı, hedeflerinden olduğu öngörülen TUBB2A anlatımında artış gözlenmiştir.
qPZR validasyonlarında, 52 pediatrik T-ALL hasta örnekleri kullanılmıştır. miR-29a, miR-29b ve miR-29c anlatımlarının, T-ALL hastalında, sağlıklı periferik T hücrelerine göre anlatımlarının düşük olmasına karşın, sağlıklı timosit örneklerindeki anlatıma göre yüksek olduğu bulunmuştur. Buna karşılık, T-ALL ve sağlıklı timosit örneklerindeki TUBB2A anlatım seviyelerinin karşılaştırılmasında, T-ALL örneklerindeki TUBB2A anlatımının yüksek olduğu bulunmuştur. Dolayısıyla, T-ALL'de, mir-29 ve öngörülen hedefi olan TUBB2A anlatımları ters yönde değil, ikisinin de anlatımının aynı yönde değiştiği gösterilmiştir.
TUBB2A anlatımı, WBC sayıları yüksek olan hasta grubunda yüksek olduğu, TUBB2A'nın daha kısa genel sağkalım ve hastalıksız sağkalımla ilişkili olduğu gösterilmiştir. Cox regresyon analizi sonuçlarına göre, TUBB2A analtımının yüksek olması, tedaviye yanıtsızlık ve nüks ile ilişkili olduğu tespit edilmiştir.
Biyoinformatik analiz bulgularının, farklı tekniklerle hastalığa özgü ve ilgili doğru sağlıklı kontrollerinde validasyonunun yapılması gerekmektedir.
|